可視化ソフトウェア Bioinformatics Toolbox™
分析質量分析法用

可視化ソフトウェア - Bioinformatics Toolbox™ - The MathWorks - 分析 / 質量分析法用
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特徴

機能
可視化, 分析
応用
質量分析法用

詳細

Bioinformatics Toolbox™ は、次世代シークエンシング(NGS)、マイクロアレイ解析、質量分析、遺伝子オントロジー用のアルゴリズムとアプリを提供します。 ツールボックス機能を使用すると、SAM、FASTA、CEL、CDFなどの標準ファイル形式だけでなく、NCBI 遺伝子発現オムニバスやGenBank® などのオンラインデータベースからゲノムやプロテオミックデータを読み取ることができます。 シーケンスブラウザ、空間ヒートマップ、クラスタグラムを使用して、このデータを探索および視覚化できます。 ツールボックスには、ピークの検出、欠落データの値の入力、およびフィーチャの選択のための統計手法も用意されています。ツールボックス機能を組み合わせて、一般的なバイオインフォマティクスワークフローをサポートできます。 ChIP-Seqデータを使用して転写因子を特定し、RNA-Seqデータを分析して差分発現遺伝子を特定し、マイクロアレイデータでコピー数多様体とSNPを特定し、質量分析データを使用してタンパク質プロファイルを分類することができます。

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