マイクロボアデザインのMetrosep A Supp 16 - 150は、中程度の容量の分離課題に最も適しています。このカラム型の内径は小さく、またそれに応じて流量も少ないため、溶離液の消費量が大幅に低減されます。少ない流量により、陰イオンが検出器にとどまる時間が延び、それに伴って、サンプル量が同じ場合ピーク領域も大きくなります。マイクロボア分離カラムは、MSM-LCと一緒に使用されます。Metrosep A Supp 16の2mm分離カラムは、4mm分離カラムと同様の素材で充填されています。このカラム型の中型バージョンは、汎用的に使用されます。
このカラムは、高いイオン負荷を示すけれども最高の分離度が必要ではない用途に適しています。溶離液の流量がごく少ないため、このカラムは特に IC-MSカップリングに適しています。